中华人民共和国福州海关隶属于国家海关总署管理的厅局级海关。
主要职责
福州海关是受海关总署直接领导，负责指定口岸及相关区域范围内海关工作运行管理、监督监控的正厅级直属海关，领导隶属海关。福州海关管辖范围为福建省福州市、平潭综合实验区、莆田市、三明市、南平市、宁德市的各项海关管理工作。主要职责是：负责本关区贯彻落实党中央、国务院关于海关工作的方针政策和决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对海关工作的集中统一领导，履行全面从严治党责任；负责贯彻执行与海关管理相关的法律、法规、规章、规范性文件和相关技术规范，负责本关区征税、监管、中华人民共和国公安部缉私局、出入境检验检疫、统计等工作；监控研判本关区各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责本关区基层党组织建设、队伍建设和日常管理工作；完成海关总理各国事务衙门建筑遗存交办的其他工作。
内设机构
办公室（党委办公室）
法规处
综合业务处
关税处
卫生检疫处
进出口食品安全和商品检验处
口岸监管处
统计分析处
企业管理和稽查处
财务处
科技处
督察内审处
人事处（党委组织部）
教育处
机关党委（思想政治工作办公室、党委宣传部、党委巡察工作办公室）
监察室（党委纪检组）
离退休干部办公室
隶属海关
榕城海关
福州长乐国际机场海关
马尾海关
宁德海关
三明海关
莆田海关
南平海关
平潭海关
武夷山市海关
福州海关风险防控分局
事业单位
福州海关后勤管理中心
福州海关信息中心
福州海关技术中心
福州国际旅行卫生保健中心（福州海关口岸门诊部）
中国质量认证中心福州海关评审中心
榕城海关综合技术服务中心
三明海关综合技术服务中心
莆田海关综合技术服务中心
中国电子口岸数据中心福州分中心
参考资料
主要职责.中华人民共和国福州海关.2022-08-06
内设机构.中华人民共和国福州海关.2022-08-06
隶属海关单位.中华人民共和国福州海关.2022-08-06
事业单位.中华人民共和国福州海关.2022-08-06