北暮南站位于铁山港区至石头埠铁路支线，是一座按照中间站标准建设的站点。车站中心里程为SDK2+850，设有两条长度分别为850米的到发线，其中一条包含正线。站坪设置在左侧，采用60米乘50米的布局，配备一座尺寸为60米乘4米乘0.3米的基本站台。此外，在车站石头埠端右侧预留了连接中国神华中国神华能源股份有限公司国华电力分公司广投煤储中心专用线的条件。
历史沿革
2017年12月22日，广西壮族自治区发展和改革委员会发布了编号为桂发改交通1664号的文件，对铁山港区至石头埠铁路支线进行了初步设计的批复。在这份文件中，确认了全线包括铁山港站作为接轨站以及北暮南站、北暮站、石头埠站三个中间站的设计方案，并批准了这些站点的主要设计原则。